L'église actuelle est édifiée sur l'emplacement de la première chapelle des jésuites construite en 1610 et détruite en 1740 lors d'un incendie. En 1743, l'architecte Dominique Delesalle dresse les plans de la nouvelle église et la première pierre est posée sous la direction de l'architecte François Joseph Gombert (mort en 1744).

Les sculpteurs Théodore Huidiez-Tierce (1810-1892) et Désiré Buisine (1793-1881) ont entrepris les lambris de revêtement du chœur ainsi que les douze médaillons représentant les apôtres, les balustrades du chœur, les confessionnaux et la chaire à prêcher. Les vitraux ont été réalisés par Charles Gaudelet (1817-1880) et les peintures monumentales en trompe-l'œil par Charles Stalars (1808-1876).